SPRimagerII?分子相互作用芯片分析系統(tǒng)
SPRimager? II芯片分析系統(tǒng)是美***GWC公司專門為分析分子間相互作用而設(shè)計(jì)的儀器。該儀器利用等離子共振原理,采用矩陣排列的芯片對(duì)樣品進(jìn)行分析,由于矩陣芯片在1-CM流動(dòng)池中是暴露在相同的樣品中,完全消除了多通道分析系統(tǒng)中通道與通道之間的差異,而且可以同時(shí)采集矩陣芯片上所有探針的數(shù)據(jù)。
無(wú)需標(biāo)記物
SPRimager II采用表面等離子共振成像(Surface Plasmon Resonance imaging, SPRi)的原理來(lái)檢測(cè)與芯片上的探針結(jié)合的分子,無(wú)需使用諸如熒光標(biāo)簽之類的標(biāo)記物。由于標(biāo)記分子涉及了對(duì)其結(jié)構(gòu)進(jìn)行化學(xué)修飾,因此有可能會(huì)影響分子的功能,這對(duì)蛋白質(zhì)組學(xué)的研究來(lái)說是***個(gè)很大的問題。因此,采用無(wú)需標(biāo)記的系統(tǒng),如SPRimager? II 是對(duì)蛋白質(zhì)相互作用的功能分析優(yōu)先選擇的途徑。
SPRimagerII可以使您在采集數(shù)據(jù)的同時(shí)觀察芯片陣列的圖像,并同時(shí)繪出相互作用的過程。這樣就大大加快了方法的建立過程,使您能夠?qū)⒆⒁饬性跈z測(cè)過程中實(shí)驗(yàn)的進(jìn)展上來(lái)。由于該系統(tǒng)無(wú)需標(biāo)記,因此,也就無(wú)需再為熒光標(biāo)記的淬滅而擔(dān)憂。
用途廣泛
如果您有多種研究興趣,或者您的實(shí)驗(yàn)方案需要改變,您會(huì)發(fā)現(xiàn)SPRimager? II的使用范圍寬廣,這對(duì)您是十分方便的。SPRimager II檢測(cè)分子間的作用,不涉及樣品的化學(xué)組成,因此該儀器用途十分廣泛:從抗體到抗生素、從細(xì)胞到細(xì)胞因子、從配基到凝集素、從寡核苷酸到寡聚糖、從毒素到轉(zhuǎn)錄因子、從蛋白質(zhì)到多肽、以及從核酸適體到酶原,SPRimager? II即可以用于您目前的研究,又可以滿足您未來(lái)的需求。以下是SPRimager? II的部分應(yīng)用領(lǐng)域:
蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用
抗體-蛋白質(zhì)相互作用
抗體-抗原之間的親和力
DNA-DNA或DNA-蛋白質(zhì)的結(jié)合過程
轉(zhuǎn)錄因子與dsDNA序列的結(jié)合
抗體的表征
抗原決定基的定位
分子作用的可逆性…
此外,不要忘記對(duì)于蛋白質(zhì)組學(xué)而言,不僅僅局限于成對(duì)的相互作用。您可以通過SPRimager? II監(jiān)測(cè)多種循序的結(jié)合事件,分析配基依賴性結(jié)合和競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合活性。已發(fā)表的文獻(xiàn)提供了***些使用這個(gè)系統(tǒng)完成的多種多樣的成功的范例。
靈活易用
用戶友好的SPRimager? II系統(tǒng)將您放在駕駛員的位置上,使得您可以選擇對(duì)研究***有利的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。您可以選擇GWC提供的任何***種應(yīng)用方法,或不斷增長(zhǎng)的文獻(xiàn)中發(fā)表的方法,也可以建立自己的方法。您可以隨時(shí)通過我們的技術(shù)代表得到全方位的支持。
要得到SPR圖像,您可使用SPRchip?或SpotReady?芯片基板,通過自動(dòng)點(diǎn)樣機(jī)或手工點(diǎn)樣方式制作芯片。用您實(shí)驗(yàn)是現(xiàn)有的移液器就可以對(duì)SpotReadyTM芯片基板進(jìn)行點(diǎn)樣了。GWC提供的所有芯片基板都是無(wú)右旋糖苷的,因此,您無(wú)需擔(dān)憂多聚物對(duì)目標(biāo)分子與芯片探針造成的非特異性干擾。
配套齊全
所有的SPRimager?II系統(tǒng)都包括了泵、流動(dòng)池、軟件,配備電腦后即可使用。將這個(gè)系統(tǒng)安裝起來(lái)并順利地運(yùn)行起來(lái)可能比您想象的還要簡(jiǎn)單,您無(wú)需投入更多的資源來(lái)學(xué)習(xí)如何使用這套系統(tǒng),只需要在儀器安裝過程中接受簡(jiǎn)單的培訓(xùn)就可以開始您的實(shí)驗(yàn)了。
SPRimager?II 系統(tǒng)主要特點(diǎn)
圖像采集容量 ― 同時(shí)采集觀察區(qū)內(nèi)的所有圖像。高靈敏度的近紅外CCD攝像機(jī)配合高通量的采集鏡頭獲得高清晰度的圖像數(shù)據(jù)。
實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)采集 ― 可以對(duì)圖像和曲線數(shù)據(jù)進(jìn)行實(shí)時(shí)顯示并存儲(chǔ)備用。
分析物傳送泵 ― 已包括在系統(tǒng)的基本配置中。可按連續(xù)流或靜息流模式采集數(shù)據(jù)。
偏振控制 ― 采集s-偏振光的響應(yīng)??梢灾苯訉⑵滢D(zhuǎn)換為絕對(duì)反射率值來(lái)比較不同實(shí)驗(yàn)的結(jié)果,而無(wú)需設(shè)定隨意的相對(duì)測(cè)量單位。
入射光角度在40o – 70o可以調(diào)節(jié) ― 可以靈活地對(duì)不同類型的表面進(jìn)行測(cè)定,可以采集液體及空氣中的SPR檢測(cè)數(shù)據(jù)。
操作波長(zhǎng)為800 nm ― 為您提供了在1-CM直徑的流動(dòng)池中測(cè)量靈敏度和分辨率***佳的平衡。也可以根據(jù)要求,GWC公司為用戶設(shè)定特定的波長(zhǎng)。
SPRimager? II系統(tǒng)在分子相互作用芯片陣列分析中的優(yōu)勢(shì)
適用范圍廣
SPRimager? II系統(tǒng)能分析幾乎的所有生物分子的相互作用。已發(fā)表的案例包括分析抗體、抗原、抗菌素、核酸適體、配體、凝集素、寡核苷酸、蛋白質(zhì)、多肽、寡聚糖、毒素、轉(zhuǎn)錄因子等等。與多通道SPR分析系統(tǒng)不同的是SPRimager? II系統(tǒng)獨(dú)特的液體系統(tǒng)設(shè)計(jì),使得人們可以監(jiān)測(cè)整個(gè)細(xì)胞及病毒體。例如,用蛋白質(zhì)配體陣列表征細(xì)胞受體特征。請(qǐng)參閱D Peelen, V Kodoyianni, J Lee, T Zhang, MR Shortreed, LM Smith2006年發(fā)表的論文:Specific capture of mammalian cells by cell surface receptor binding to ligand immobilized on gold thin films。J. Proteome Res. 5:1580-1585。
探針數(shù)量及點(diǎn)板格式有很大的空間供用戶選擇
多通道SPR系統(tǒng)多是在2至4通道中放置探針,因此,每次***多只能分析2至4個(gè)探針。即便是花費(fèi)USD 750,000或更多的昂貴系統(tǒng)***次分析的探針***多也不超過20個(gè)。與其不同,SPRimager? II 系統(tǒng)采用的是開放式的工作平臺(tái),使用者完全可以自行控制探針的數(shù)量及點(diǎn)板格式:
選擇用于快速手工點(diǎn)樣預(yù)制的SpotReadyTM芯片基板。
選擇SpotReadyTM芯片允許使用移液器手工點(diǎn)樣。
純金斑點(diǎn)(每個(gè)SpotReadyTM芯片有16或25個(gè)點(diǎn))周圍涂有疏水層 — 使溶于水的探針形成1 – 2 微升的不連續(xù)小珠。
SpotReadyTM基板特別適用于快速的方法開發(fā)以及低密度的陣列。
SpotReadyTM芯片基板主要用于自動(dòng)點(diǎn)樣操作及高密度陣列。
SpotReadyTM芯片基板具有均***的純金表面,可以用于各種陣列格式。
適用于針尖式點(diǎn)樣系統(tǒng)及壓電式點(diǎn)樣系統(tǒng)。
GWC提供的這種芯片基質(zhì)的適用性使你可以對(duì)從幾個(gè)到幾百個(gè)探針的陣列進(jìn)行分析,并允許你而不是儀器來(lái)控制實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。而且,無(wú)論是選用SpotReadyTM或SpotReadyTM芯片基板構(gòu)建陣列,你都不會(huì)受到儀器的限制。
得到更完整的信息
市面上多通道分析系統(tǒng)提供的實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)對(duì)于常規(guī)使用是可以的。但是如果你想知道探針與分析物的作用過程發(fā)生了什么,你就需要得到原始數(shù)據(jù)。而目前市面上的SPR產(chǎn)品均不能提供這些信息。GWC的SPRimager? II平臺(tái)可以為你提供每次分析的原始數(shù)據(jù)。此外,由于SPRimager? II系統(tǒng)采集矩陣的實(shí)時(shí)圖像,因此可以向你提供發(fā)生在芯片矩陣上的實(shí)時(shí)變化。而這些變化是十分珍貴的肉眼可見的顯示。這***功能對(duì)于方法的建立和嚴(yán)格的實(shí)驗(yàn)解釋都是不可缺少。
SPRimager? II系統(tǒng)通過儀器的高精度的視頻采集電路向控制電腦傳送CCD圖像。圖像數(shù)據(jù)通過V++分析軟件進(jìn)行定量分析及圖像顯示。定量數(shù)據(jù)通過Excel進(jìn)行實(shí)時(shí)繪圖并提供完整的原始數(shù)據(jù)。系統(tǒng)允許你自由地進(jìn)行各種數(shù)據(jù)分析。
更嚴(yán)格
市面上的多通道系統(tǒng)分析的是相互獨(dú)立的平行通道中發(fā)生的作用。而在SPRimager? II陣列系統(tǒng)中,所有芯片陣列上的探針都是堡壘在完全相同的分析物溶液中,并且從每***個(gè)探針采集數(shù)據(jù)的時(shí)間都完全相同。芯片陣列包括了正負(fù)控制探針,所提供的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)是***為嚴(yán)謹(jǐn)?shù)?— 完全不需要另行設(shè)立單獨(dú)的控制探針通道。如果***臺(tái)雙通道的系統(tǒng)要同時(shí)監(jiān)控正負(fù)控制物就沒有通道來(lái)處理實(shí)驗(yàn)樣品了!
陣列模式除了實(shí)驗(yàn)的嚴(yán)謹(jǐn)性之外,GWC的陣列芯片基板從不使用右旋糖苷或其它可能引起混亂的多聚物來(lái)固定探針。這些多聚物會(huì)通過物理的阻礙或其帶電的性質(zhì)來(lái)阻礙分析物分子接近探針分子,因此會(huì)導(dǎo)致對(duì)親和評(píng)估的錯(cuò)誤信息。例如,在右圖所示的結(jié)合平衡實(shí)驗(yàn)中,對(duì)于相同的分子,未使用右旋糖苷的結(jié)合比使用右旋糖苷的結(jié)合具有更好的親和結(jié)果。請(qǐng)參閱Subramanian等人2006年發(fā)表的論文:An improved surface plasmon resonance method for determining the molecular basis of the calcium-dependent interactions of ALG-2, Calcium Binding Proteins. 1:56-61。
SpotReady?芯片基板規(guī)格
項(xiàng)目SpotReady? 16SpotReady?25貨號(hào)SPR-1000-016SPR-1000-025每個(gè)芯片基本的金斑數(shù)1625斑點(diǎn)直徑1 mm0.7 mm建議點(diǎn)樣體積包裝0.5μL每包5片0.3μL每包5片
SPRimager? II系統(tǒng)相關(guān)資料(請(qǐng)點(diǎn)擊下列標(biāo)題):
1、SPR Imaging: Introduction (英文)
2、SPR Imaging Special Resolution (英文)
3、SPR Imaging Sensitivity (英文)